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圖2MAZTER-Seq實(shí)驗(yàn)流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗(yàn)證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下，檢測到的剪切效率高于野生型（剪切效率高低m6A水平），m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠，那檢測的特異性位點(diǎn)是否準(zhǔn)確呢？作者也將該方法檢測到的新甲基化位點(diǎn)使用放射標(biāo)記層析檢測，發(fā)現(xiàn)預(yù)測的位點(diǎn)準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中，作者則是與m6A抗體IP的方法進(jìn)行了比較，也證實(shí)了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測結(jié)果驗(yàn)證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外，后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)**模型中檢測了MAZTER-Seq這一系統(tǒng)；并進(jìn)一步通過這一方法檢測了哺乳動(dòng)物不同細(xì)胞間m6A水平的保守性；也探究了去甲基化酶FTO對整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù)，其他部分暫不過多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究內(nèi)容；對于這一技術(shù)?？蒲屑夹g(shù)服務(wù)致力于推動(dòng)前沿科技的研究與發(fā)展，為企業(yè)提供定制化的技術(shù)解決方案。上海實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)外包

m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制：通過m6A甲基化測序（MeRIP-Seq,miCLIP）構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜，分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布，Peak關(guān)聯(lián)基因的特征，聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制，作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1，通過qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實(shí)驗(yàn)證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié)，作者研究了FOXM1的鄰近基因，發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補(bǔ)，且共表達(dá)、共定位，進(jìn)一步通過RIP,RNApulldown等實(shí)驗(yàn)證明lncRNAFOXM1-AS促進(jìn)ALKBH5和FOXM1初級轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達(dá)和細(xì)胞增殖，從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細(xì)胞中m6A修飾的特征和基因表達(dá)的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進(jìn)了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化，組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。上?？蒲屑夹g(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)實(shí)驗(yàn)干貨 | 分子克隆實(shí)驗(yàn)——無縫克隆。

1.首要原則：細(xì)胞不重要情況下立即丟棄，培養(yǎng)箱滅菌，所用培養(yǎng)基也都要丟棄，器械等重新滅菌或拆用新的。2.細(xì)菌污染一般都救不回來了，發(fā)現(xiàn)的時(shí)候培養(yǎng)基一般都很渾濁且細(xì)胞都死了3.污染且細(xì)胞很重要時(shí)：遇到念球菌污染，且細(xì)胞為基因改造細(xì)胞，非常重要。如231貼壁乳腺細(xì)胞，發(fā)現(xiàn)細(xì)胞周圍出現(xiàn)很小的串珠透亮圓點(diǎn)，非常像念球菌污染，此時(shí)細(xì)胞狀態(tài)尚可，且污染少。處理如下：用預(yù)熱或室溫PBS清洗3次，可適當(dāng)振搖，將污染沖洗下來。隨后加入10-20%雙抗到培養(yǎng)瓶，置于37度培養(yǎng)箱1h，之后再用PBS清洗三遍，直至視野下無可見污染。此時(shí)細(xì)胞也被沖下大部分，因此此方法只適用在細(xì)胞貼壁強(qiáng)，狀態(tài)好，密度高時(shí)使用。之后每天再更換培養(yǎng)基，每次用PBS沖洗2遍。過幾天細(xì)胞狀態(tài)尚可時(shí)，消化離心時(shí)用500r，3min，去掉上清，重復(fù)3次。這個(gè)方法是根據(jù)文獻(xiàn)可利用念球菌和細(xì)胞體積重量差異實(shí)現(xiàn)分離?；旧线@一步做完以后，污染就基本了，接下來就注意多觀察，勤換液就行。

采用opti-MEM和Lipo3000分別轉(zhuǎn)染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG質(zhì)粒及對照載體，每皿加入脂質(zhì)體-質(zhì)粒轉(zhuǎn)染混懸液按購買脂質(zhì)體相關(guān)說明書操作定量。繼續(xù)培養(yǎng)24h。2)24小時(shí)后，將培養(yǎng)基更換為新鮮的DMEM完全培養(yǎng)基，放進(jìn)細(xì)胞培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)48~72h。3)48~72h后收集上層培養(yǎng)液，并過μm濾膜，采用ELISA法對所獲得的慢載體進(jìn)行滴度測定。如不及時(shí)使用可以凍存于-80℃。3、慢轉(zhuǎn)染1)轉(zhuǎn)染前1天將細(xì)胞接種6孔培養(yǎng)板，時(shí)細(xì)胞的融合率約為50%，前需換液，加入1mLDMEM完全培養(yǎng)基。2)冰浴融化后加入相應(yīng)體積的液及聚凝胺（Polybrene），混勻后放入37℃孵箱中繼續(xù)培養(yǎng)3)4h后補(bǔ)充1mL培養(yǎng)基，14h后換液（24h內(nèi)換液即可）。4)72h后用倒置顯微鏡觀察熒光，監(jiān)測效率，出現(xiàn)較多熒光時(shí)將等量的轉(zhuǎn)染細(xì)胞和未轉(zhuǎn)染細(xì)胞分別加入等濃度Puromycin（Puromycin或其他篩選濃度需要事先摸索）。5)待未轉(zhuǎn)染細(xì)胞全部死亡并且可觀察到滿意熒光量時(shí)，降低Puromycin濃度培養(yǎng)。也可以挑去單克隆細(xì)胞株進(jìn)行進(jìn)一步培養(yǎng)，以得到滿意的穩(wěn)定表達(dá)目的基因的細(xì)胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法檢測目的基因的表達(dá)量和蛋白水平是否顯著提高。7)由此可得三組細(xì)胞株：a.正常細(xì)胞株；b.空載載體的細(xì)胞株。動(dòng)物疾病模型：為人類健康保駕護(hù)航。

2）固定的目的①保持其原有狀態(tài)：使細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)、脂肪、糖、酶等成分轉(zhuǎn)變?yōu)椴蝗苄晕镔|(zhì)，迅速防止、細(xì)胞的死后變化，防止自溶與，防止細(xì)胞過度收縮或膨脹而失去其原有形態(tài)結(jié)構(gòu)，使之盡量保持生前的狀態(tài)和結(jié)構(gòu)。②以便染色后易于鑒別和觀察：不同成分對染料有不同的親和力，以便染色后易于鑒別和觀察。③使塊硬化，便于制作薄片（塊在脫水、包埋、切片、染色等過程中不易損壞）。（3）固定液固定液種類：一類是單純固定液，即只有一種試劑；另一類是混合固定液，由兩種或兩種以上試劑組成。作為較好的固定液，應(yīng)有下列特性，首先，有強(qiáng)滲透力，能迅速的滲入內(nèi)部；其次，不使過度收縮或膨脹，并能使內(nèi)欲觀察的成分得以凝固為不溶性物質(zhì)；能使達(dá)到一定的硬度并獲得較佳的折光率和對某些染料具有較強(qiáng)的親和力。固定液通常使用10%的甲醛溶液。特殊要求的，常需要特殊的固定液，取樣之前應(yīng)做好準(zhǔn)備。如眼球樣本應(yīng)使用FAS眼球固定液，脂肪應(yīng)使用脂肪固定液等。此外，在進(jìn)行骨樣本制備的時(shí)候，還應(yīng)注意提前進(jìn)行脫鈣處理，可根據(jù)具體情況選擇慢脫鈣或快脫鈣處理?？偟膩碚f，樣品的采集是實(shí)驗(yàn)中至關(guān)重要的一環(huán)，如果取樣環(huán)節(jié)出現(xiàn)了偏差，往往會(huì)導(dǎo)致后續(xù)檢測結(jié)果的偏移。這種技術(shù)是將蛋白質(zhì)視為抗原，并利用抗體與之進(jìn)行特異性結(jié)合的特性，來進(jìn)行研究。上海實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)

干貨分享 | 避坑，微生物培養(yǎng)的污染因素及預(yù)防方法，少走彎路。上海實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)外包

實(shí)驗(yàn)樣本分類實(shí)驗(yàn)一般采取樣本有：血液樣本、樣本和細(xì)胞樣本。通常，樣本采集后，應(yīng)立即用等滲溶液（PBS或生理鹽水）盡量把血液漂洗干凈（除非血液也是分析對象），用濾紙或紗布吸干，把樣本分切成幾分，每份的體積約2個(gè)黃豆大小，每份用一個(gè)管子裝。血液樣本的采集應(yīng)根據(jù)不同實(shí)驗(yàn)的要求，將會(huì)采取不同策略。血清樣本：全血中不加抗凝劑，血液凝固后取出的不含凝血因子的淡黃色透明液體。（全血標(biāo)本室溫放置2小時(shí)3000rpm/min離心15min）血漿樣本：全血中加抗凝劑，血液凝固后取出的含凝血因子的淡黃色透明液體。（可用EDTA或肝素作為抗凝劑，標(biāo)本采集后30分鐘內(nèi)于2-8℃，3000rpm/min離心15min）如果是做生化ELISA等檢測可以考慮血漿和血清，根據(jù)獲得的樣本量可考慮分裝成100-500μl/管，可避免反復(fù)凍融造成的檢測誤差。生化：建議優(yōu)先選擇血清，其次選擇肝素抗凝血漿；ELISA：建議優(yōu)先選擇血清，其次選擇肝素或EDTA抗凝血漿；凝血實(shí)驗(yàn)：只能選擇枸櫞酸鈉抗凝血漿；血常規(guī)：只能選擇EDTA抗凝全血；如果要收集其中的白細(xì)胞、血小板等建議用抗凝全血。如果要做流式建議用專門的流式用血液收集管，防止表面抗原的丟失，或者盡快安排就近檢測。樣本處理取樣完后。上海實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)外包